Его работа сосредоточена на продвижении науки и образования в Кыргызстане.
Алтай Борубаев является академиком Национальной академии наук Кыргызской Республики и получил множество наград, включая Межгосударственную премию СНГ «Звезды содружества». Он дважды становился лауреатом Государственной премии Кыргызской Республики в области науки и техники, а также удостоен звания заслуженного деятеля науки. В числе его наград — орден «Манас» III степени и орден «Содружество» Межпарламентской ассамблеи СНГ. В данный момент он занимает пост директора Института математики Национальной академии наук Кыргызской Республики.
Борубаев является автором 16 научных монографий и книг, а также более 130 научных статей, которые были опубликованы в 15 странах. Он представил свои научные работы в университетах 39 стран по всему миру. Под его руководством в республике прошло свыше 20 международных научных конгрессов и конференций.
На сегодняшний день он также занимает пост президента Союза ученых Кыргызстана, является членом Президиума Национальной академии наук КР и руководителем Кыргызского математического общества. Кроме того, он является членом редакционных советов нескольких международных научных журналов по математике.
