Как сообщил Мураталли Тажимамат Абдураимов, ответственный за мечеть, дехканин по имени Мамаюсуп Ходжи решил возвести храм для местных верующих. Он финансировал строительство из собственных средств и пригласил мастеров из известных узбекских городов, таких как Самарканд и Хива, для украшения стен и потолков мечети. Первоначальная площадь здания составляла 13 на 12 метров.
С приходом советской власти, которая отрицала религию, в помещениях мечети разместили райпотребобщество Кара-Суйского района.
В послевоенные годы в этом здании была организована пекарня, где производили нават.
В 1981 году, по просьбе местных жителей, мечеть была вновь открыта и получила название «Бокий», что переводится как «Вечная».
Тем не менее, в начале девяностых годов потомки основателя мечети обратились с просьбой вернуть ей имя её создателя.
Таким образом, мечеть снова стала называться Мамаюсуп Ходжи-Ата, в честь человека, который её построил.
Следует отметить, что в XVI и XVII веках искусство каллиграфии и переплётного дела достигло значительных высот в религиозных и культурных памятниках. Художественное оформление внутренних пространств зданий включало изящную каллиграфию и тонкие орнаменты, выполненные водяными красками. Среднеазиатская школа растительной росписи и миниатюры стала известной в городах Великого шелкового пути. Здесь также развивались различные стили, каждый из которых отличался утонченностью архитектурных форм и высоким мастерством исполнителей.
